原木素材游戏活动站 - 沙盒建造最新资讯

原木素材游戏活动站 - 沙盒建造最新资讯

VASP教程 | VASP零点振动能和熵计算流程!

Home 2026-02-28 21:10:28 VASP教程 | VASP零点振动能和熵计算流程!

VASP教程 | VASP零点振动能和熵计算流程!

ISTART=0 #开始新的任务,随机产生初始波函数 ICHARG=2 #开始新的任务,从原子电荷密度产生体系初始电荷密度 PREC=M #计算精度,决定ENCUT ISPIN=2 #打开

  • admin 建造大赛
  • 2026-02-28 21:10:28

ISTART=0 #开始新的任务,随机产生初始波函数

ICHARG=2 #开始新的任务,从原子电荷密度产生体系初始电荷密度

PREC=M #计算精度,决定ENCUT

ISPIN=2 #打开自旋极化

ALGO=N #确定电子优化的算法

NELM=60 #电子波函数最多计算60步

EDIFF=1E-5 #相邻两步电子迭代的能量差收敛标准

ENCUT=400 #平面波截断能400 eV

IVDW=11 #考虑范德华力修正

IBRION=5 #原子振动频率计算

NSW=1 #离子弛豫的步数

ISIF=2 #固定晶格优化原子坐标

EDIFFG=-0.1 #离子弛豫的force的收敛标准

ISMEAR=0 #费米能级附近电子占据数为高斯分布,适合金属、半导体、绝缘体

SIGMA=0.1 #高斯分布展宽0.1 eV

NFREE = 2 #中心差分法计算能量对位移的微分

POTIM=0.015 #差分法步长

KPOINTS文件:

Automatic generation #注释行

0 #自动产生K点网格

G #布里渊区K点网格以Gamma点为中心

6 6 1 #K点网格密度

0 0 0 #K点网格中心平移矢量

pt001吸附原子振动频率计算

第一步,进入pt计算文件夹

cd crystal/pt

将结构优化h文件夹复制成自洽计算h2ofreq文件夹

cp -r h2o h2ofreq

进入h2ofreq文件夹

cd h2ofreq

把 CONTCAR 复制成POSCAR

cp CONTCAR POSCAR

第二步,修改结构优化的 INCAR 文件

修改 INCAR 文件,修改IBRION=5、NSW=1、NFREE=2、POTIM=0.015。

vi INCAR

第三步,提交振动计算

sbatch JOB

计算完成后查看输出文件output

cat output

第四步,用zpe和ts脚本提取零点振动能和熵

总结

今天华算科技朱老师给大家介绍Pt吸附水之后的零点振动能及熵计算,这个常用于催化案例中。之前已经做好了吸附水的结构计算,然后把它这个文件夹复制成 h2ofreq 做振动计算,首先把结构保留下来,然后修改INCAR,IBRION 改成5, NSW 改成1,再加上 NFREE 等于2,POTIM 等于0.015,这里的ISTART 和 ICHARG也改成1,读取波函数及电荷密度加快计算。POSCAR当中的原子坐标除了吸附原子以外其他都固定,也就是说催化剂都是F,只计算吸附物质的振动频率和对能量的贡献,提交任务。

这边有说有限差分法的步长是0.015,自由度是 9 个,因为是三个原子水分子,每个原子有三个自由度,那么总共是九个自由度,采用的是中心差分,每个自由度算两个位移来做一个差分代替微分的这样一个计算,所以就二九一十八个能量计算完成之后就可以得到振动频率,算完之后用两个脚本分别提取零点振动能和熵的数值。

振动计算会随着吸附物种原子数的增加计算量而增加,这就是为什么会把催化剂原子给固定,如果不固定的话,催化剂动辄两三百个原子,那这个计算量还是很大的。

算完之后用第一个脚本 zpe 提取它的振动能0.58,再用第二个脚本ts,这里要输入温度298.15K。它的熵是 0.15 eV,这样就把振动和熵数据的提取给大家介绍完了。返回搜狐,查看更多

  • 数字化国泰君安,以APP传递高质量服务,凭六大王牌,君弘APP"黏住"3200万用户
Copyright © 2088 原木素材游戏活动站 - 沙盒建造最新资讯 All Rights Reserved.
友情链接